Nos tutelles

CNRS UCA

Nos partenaires

FRE Recherches en Environnement FEDER

Rechercher




Accueil > Français > Annuaire > Permanents > LEPERE Cécile

LEPERE Cécile

par DavidB - publié le , mis à jour le

Maître de Conférences,
Université Blaise Pascal

Contact :

Laboratoire Microorganismes : Génome et Environnement

UMR CNRS 6023

Bât. A, 24 avenue des Landais,

63177 Aubière Cedex. France.

Tél : 33 (0)4 73 40 74 60

Fax : 33 (0)4 73 40 76 70

Courriel : cecile.lepere@uca.fr

Bureau : 1142 (1er étage)

TRAVAUX DE RECHERCHE

Thématique : Diversité et rôles fonctionnels des communautés microbiennes dans les écosystèmes aquatiques :

-  Importance du parasitisme dans les réseaux trophique aquatique : rôle des parasites eucaryotes (Champignons, Alvéolés) dans la régulation des populations planctoniques
-  Diversité et biogéographie des protistes (espèces rares)
-  Diversité et structure spatiale du picophytoplancton : plasticité métabolique, la clé du succès ?

PUBLICATIONS

• Li S., Shi X., Lepère C., Liu M., Wang X., Kong F. (2016). Unexpected predominance of eukaryotic picophytoplankton in shallow eutrophic Lakes. Journal of Plankton Research.DOI : 10.1093/plankt/fbw042

• West NJ., Lepère C., de O. Manes CL., Catala P., Scanlan DJ., Lebaron P. (2016). Distinct patterns of SAR11, SAR86 and Actinobacteria diversity along a transect in the ultra-oligotrophic South Pacific Ocean. Frontiers in Microbiology. doi : 10.3389/fmicb.2016.00234

• Lepère C., Domaizon I., Hugoni M., Vellet A., Debroas D. (2016). Diversity and dynamics of active microbial eukaryotes in the anoxic zone of a freshwater meromictic lake (Pavin, France). Frontiers in Microbiology. doi : 10.3389/fmicb.2016.00130

• Lepère C., Ostrowski M., Hartmann M., Zubkov MV., Scanlan DJ. (2015). In situ associations between marine photosynthetic picoeukaryotes and potential parasites – a role for fungi ? Environ Microbiol Rep doi : 10.1111/1758-2229.12339.

• Hartmann M, Zubkov MV, Scanlan DJ, Lepère C. (2013). In situ interactions between photosynthetic picoeukaryotes and bacterioplankton in the Atlantic Ocean : evidence for mixotrophy. Environmental Microbioloy Reports 5:835-840

• Lepère C., Domaizon I., Taïb N., Mangot JF., Bronner G., Boucher D., Debroas D. (2013) Geographic distance and ecosystem size determine the distribution of smallest protists in lacustrine ecosystems. FEMS Microbiol Ecol 85 : 85-94

• Lepère C*., Kirkham A*., Jardillier L., Mead A., and Scanlan DJ. (2013). A global perspective on marine photosynthetic picoeukaryote community structure. ISME Journal 7:922-936 (*les 2 premiers auteurs sont co-auteurs).

• Hugoni M., Etien S., Bourges A., Lepère C., Domaizon I., Mallet C., Bronner G., Debroas D., Mary I. (2013). Dynamics of ammonia-oxidizing Archaea and Bacteria in contrasted freshwater ecosystems. Research in Microbiology 164:360-370

• Domaizon I, Lepère C., Debroas D., Ghiglione J.F, Jacquet S., Bouvy M., Bettarel Y., Bouvier C., Torréton J.P., Vidussi F., Mostajir B., Kirkham A., LeFloc’h E., Fouilland E., Montanié H., and Bouvier T. (2012). Effects of uv radiation, temperature and nutrient increase on the diversity and community structure of small eukaryotes in a Mediterranean coastal lagoon. BMC Microbiology 12:202 215.

• Vaulot D., Lepère C., Toulza E., De la Iglesias R., Poulain J., Gaboyer F., Moreau H., Vandepoele K., Ulloa O., Gavory F and Piganeau G. (2012). Metagenomes of the picoalga Bathycoccus from the Chile upwelling. Plos One (7(6) : e39648).

• Bouman HA., Lepère C., Scanlan D J and Ulloa O. (2012). Phytoplankton community structure in a high-nutrient, low-chlorophyll region of the eastern Pacific Subantarctic region during winter-mixed and summer-stratified conditions Deep-Sea Research. Part 1 : Oceanographic Research 69:1-11.

• Lepère C., Demura M., Kawachi M., Romac S., and Vaulot D. (2011). Whole genome amplification (WGA) of marine photosynthetic eukaryote populations. FEMS Microbiology Ecology : 76 : 513-523.

• Shi X. L., Lepère C., Scanlan DJ., and Vaulot D. (2011). Plastid 16S rRNA gene diversity among eukaryotic picophytoplankton sorted by flow cytometry from the South Pacific Ocean. Plos One : 10.1371/journal.pone.0018979.

• Lepère C., Masquelier S., Mangot JF., Debroas D., and Domaizon I. (2010). Vertical distribution of small eukaryotes (< 5 µm) in lakes differing by their trophic level. ISME Journal : 4 : 1509-1519.

• Lepère C., Vaulot D., and Scanlan D. J. (2009). Photosynthetic picoeukaryote community structure in the South East Pacific Ocean encompassing the most oligotrophic waters on Earth. Environmental Microbiology : 11 : 3105-3117.

• Mangot JF., Lepère C., Bouvier C., Debroas D., and Domaizon I. (2009). Structure and dynamics of small eukaryotes (< 5 µm) targeted by new oligonucleotide probes : a new insight into the lacustrine microbial food web. Applied and Environmental Microbiology : 75 : 6373-6381.

• Lepère C., Domaizon I., and Debroas D. (2008). Community composition of freshwater small eukaryotes (Bourget Lake) : unexpected diversity of potential parasites. Applied and Environmental Microbiology : 74 : 2940-2949.

• Lepère C., Domaizon I., and Debroas D. (2007). Community composition of lacustrine small eukaryotes in hyper-eutrophic conditions in relation to top down and bottom up factors. FEMS Microbial Ecology : 61 : 483-495.

• Lepère C., Boucher D., Jardillier L., Domaizon I., and Debroas D. (2006). Structure and regulation factors of eukaryotic picoplankton in lacustrine ecosystem. Applied and Environmental Microbiology : 72 : 2971-2981.

• Lefranc M., Thénot A., Lepère C., and Debroas D. (2005). Genetic diversity of small eukaryotes in lakes differing by their trophic status. Applied and Environmental Microbiology : 71 : 5935-5942.