Nos tutelles

CNRS UCA

Nos partenaires

FRE Recherches en Environnement FEDER

Rechercher




Accueil > Français > Annuaire > Permanents > BATISSON Isabelle

Isabelle BATISSON

Maître de conférences

publié le , mis à jour le

Contact :

UMR CNRS 6023 Microorganismes : Génome et Environnement
1 Impasse Amélie Murat,
TSA 60026
CS 60026
63178 Aubière Cedex. France.

Tél : 33 (0)4 73 40 78 70

Fax : 33 (0)4 73 40 76 70

Isabelle.BATISSON@uca.fr

Thèmes de recherche

- Axe 2 :

Microbiologie environnementale

- Thématique de recherche :

Ecotoxicologie microbienne

Recherches actuelles

Etude de l ?impact de produits phytosanitaires sur l’activité et la diversité des communautés microbiennes aquatiques et terrestres : approches expérimentales et in situ.
Isolement de souches icapables de dégrader les herbicides.
Mise en évidence des gènes et protéines impliqués dans la dégradation.

Mots clés :

  • Microorganismes étudiés : bactéries, champignons
  • Ecosystème : Sol ; sédiment ; colonne d’eau (eau douce) ;
  • Echelle d’étude : cellule ; population ; communauté ; écosystème ;
  • Techniques mises en œuvre :
    Biologie moléculaire : PCR-TTGE, clonage, hybridation sur colonies, FISH, 2D-DIGE…
  • Microbiologie : culture, isolement, caractérisation et identification de souches…
  • Bioinformatique : Blast, Align, ARB, RDP, Gel Compar…
    Chimie (en collaboration) : Dosage de pesticides (HPLC, RMN,…)

Parcours de recherche

  • 1995 - Stage de DEA (Laboratoire de Développement et Reproduction CNRS URA 1940 Clermont- Ferrand ; Responsable Laurent Morel) : "Le gène hybride MSVSP99-CAT : étude de son activité en culture de cellules et obtention d’animaux transgéniques".

Ce travail s’inscrit dans une thématique générale d’étude de la régulation de l’expression de gènes hormono-dépendants.
 Fusions génétiques ; Southern blot ; Expression de protéines recombinantes ; Culture de cellules eucaryotes ; Transgénèse.

  • 1995/1999 - Thèse (INRA Clermont-Ferrand/Theix, Laboratoire de Microbiologie ; Directeur de l’Unité et de Thèse : Michel Contrepois - Responsable : Maurice Der Vartanian) : "Fusions génétiques entre la sous-unité majeure ClpG des fimbriae CS31A et la toxine thermostable STh de Escherichia coli : secrétion, maturation, entérotoxicité, antigénicité et immunogénicité".

Ce travail s’inscrit dans le cadre du développement de vaccins recombinants pour la lutte contre les bactéries pathogènes.
 Fusions génétiques et de protéines de fusion ; Etude de l’état d’oxydo-réduction des protéines ; Obtention d’anticorps polyclonaux (lapins, souris) ; Tests immunologiques (Western blot, ELISA).

  • 1999/2001 - Stage post-doctoral (Université de Montréal, Faculté de Médecine Vétérinaire, Groupe de Recherche sur les Maladies Infectieuses du Porc, Laboratoires de Pathologie-Microbiologie et de Biologie Moléculaire ; Responsables Josée Harel et John Fairbrother).
    "Développement de stratégies diagnostiques et thérapeutiques contre les E. coli attachant-effaçant AEEC".

Travail situé dans le cadre d’un projet européen dont le thème général est l’étude de la pathogénicité, de l’épidémiologie et de la réponse de l’hôte suite aux infections dues aux AEEC.
 Réalisation et purification de protéines de fusion ; Mutant par échange allélique ; Immunisation d’animaux (lapins, poules) ; Purification d’anticorps ; Modèle de cultures d’organes ; Modèle d’infection in vivo.

  • 2001/2002 - ATER (Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand II), Laboratoire Parasitologie Moléculaire et Cellulaire ; Responsable : Christian Vivarès).
    Sujet : Etude du rôle des protéines du cytosquelette au cours du cycle de vie d’une microsporidie : Encephalitozoon cuniculi.
     Fusion génétique ; Production et purification de protéines recombinantes ; Tests d’immunofluorescence ; Microscopie électronique.
  • Depuis Septembre 2002 : Maîtres de Conférences au Laboratoire : Microorganismes : génome et environnement (LMGE), UMR CNRS 6023, Equipe « Ecotoxicologie Microbienne » (Responsable : Jacques Bohatier).

- Juin 2012 - Habilitation à diriger : De la santé animale et humaine à la santé de l’environnement.

Bibliographie

Ouvrages collectifs

  • Batisson I., Bohatier J., Bonnet J-L., Bonnemoy F., Besse-Hoggan P., Combourieu B., Sancelme M., Ter Halle A., Pilichowski J-F., Richard C., Sarakha M., Wong-Wah-Chung P. Les xénobiotiques : devenir et impact dans l ?environnement. Dans « L ?environnement : un pôle de compétences en Auvergne ». Revue D ?Auvergne. 2009. Vol 592-593 : 39-54. eds. Alliance universitaire d ?Auvergne.
  • Batisson I., Sancelme M., Mallet C., and Besse-Hoggan P. Fate and environmental impact of the recently marketed herbicide mesotrione : coupling biological and chemical studies for a global overview. Dans « Current Research, Technology and Education Topics in Applied Microbiology and Microbial Biotechnology ». Microbiology Book Series. 2010. Vol 1 : 287-294. Publisher : Formatex Research Center. Ed. Antonio Mendez Vilas.

Articles

  • Joly P., Bonnemoy F., Besse-Hoggan P., Batisson I., Bohatier J., Mallet C. Impact of maize herbicides cocktail Callisto® and Dual Gold® on soil microbial communities. IRSN Ecology. 2011.
  • Crouzet O., Batisson I., Besse-Hoggan P., Bonnemoy F., Bardot C., Poly F., Bohatier J., Mallet C. Response of soil microbial communities to the herbicide mesotrione : a dose-effect microcosm approach. Soil Biology and Biochemistry. 2010. 42 (2) : 193-202.
  • Accinelli C., Saccà M.L., Batisson I., Fick J., Mencarelli M., Grabic R. Removal of oseltamivir (Tamiflu) and other selected pharmaceuticals from wastewater using a granular bioplastic formulation entrapping propagules of Phanerochaete chrysosporium. Chemosphere. 2010. 81(3) : 436-443.
  • Batisson I., Crouzet O., Besse-Hoggan P., Sancelme M., Mangot J-F., Mallet C., Bohatier J. Isolation and characterization of mesotrione-degrading Bacillus sp. from soil. Environmental Pollution. 2009. 157 : 1195-1201.
  • Lehours A-C., Batisson I., Guedon A., Mailhot G., Fonty G. Diversity of culturable bacteria, from the anaerobic zone of the meromictic Lake Pavin, able to perform dissimilatory-iron reduction in different in vitro conditions. Geomicrobiology Journal. 2009. 26 (3) : 212-223.
  • Pesce S., Batisson I., Bardot C., Fajon C., Portelli C., Montuelle B., Bohatier J. Response of spring and summer riverine microbial communities following glyphosate exposure. Ecotoxicology and Environmental Safety. 2009. 72(7) : 1905-1912.
  • Valiente Moro C., Crouzet O., Rasconi S., Thouvenot A., Coffe G., Batisson I., Bohatier J. New design strategy for development of specific primer sets for PCR-based detection of Chlorophyceae and Bacillariophyceae : application to environmental samples. Applied and Environmental Microbiology. 2009. 75(17) : 5729-5733.
  • Pesce S., Bardot C., Lehours A.-C., Batisson I., Bohatier J. Et Fajon C. (2008). Effects of diuron in microcosms on natural riverine bacterial community composition : new insight into phylogenetic approach using PCR-TTGE analysis. Aquat. Sci. (sous presse).
  • Isabelle Batisson, Stéphane Pesce, Pascale Besse-Hoggan, Martine Sancelme, Jacques Bohatier Isolation and characterization of diuron-degrading bacteria from lotic surface water. Microbial Ecology. 2007 54(4):761-70.
  • Francis Girard, Isabelle Batisson, Gabriela Martinez, Cynthia Breton, Josée Harel, and John M. Fairbrother
    Use of Virulence Factor-Specific Egg Yolk-Derived Immunoglobulins as a Promising Alternative to Antibiotics for Prevention of Attaching and Effacing Escherichia coli Infections. FEMS Immunol Med Microbiol. 2006 Apr ;46(3):340-50.
  • Francis Girard, Isabelle Batisson, Gad Frankel, Josée Harel, John M. Fairbrother.
    Interaction of enteropathogenic and Shiga toxin-producing Escherichia coli and porcine intestinal mucosa : role of intimin and Tir in adherence. Infect Immun. 2005 Sep ;73(9):6005-16.
  • Batisson I, Guimond MP, Girard F, An H, Zhu C, Oswald E, Fairbrother JM, Jacques M, Harel J.
    Characterization of the novel factor paa involved in the early steps of the adhesion mechanism of attaching and effacing Escherichia coli. Infect Immun. 2003 Aug ; 71(8):4516-25.
  • Dezfulian H, Batisson I, Fairbrother JM, Lau PC, Nassar A, Szatmari G, Harel J.
    Presence and characterization of extraintestinal pathogenic Escherichia coli virulence genes in F165-positive E. coli strains isolated from diseased calves and pigs. J Clin Microbiol. 2003 Apr ;41(4):1375-85.
  • Batisson I, Der Vartanian M.
    Contribution of defined amino acid residues to the immunogenicity of recombinant Escherichia coli heat-stable enterotoxin fusion proteins. FEMS Microbiol Lett. 2000 Nov 15 ;192(2):223-9.
  • Batisson I, Der Vartanian M, Gaillard-Martinie B, Contrepois M.
    Full capacity of recombinant Escherichia coli heat-stable enterotoxin fusion proteins for extracellular secretion, antigenicity, disulfide bond formation, and activity. Infect Immun. 2000 Jul ;68(7):4064-74.
  • Batisson I, der Vartanian M.
    Extracellular DsbA-insensitive folding of Escherichia coli heat-stable enterotoxin STa in vitro. J Biol Chem. 2000 Apr 7 ;275(14):10582-9.

Brevet

  • Fairbrother J.M., Harel J., Batisson, I., Girard F. et Guimond M.P. : “Antibodies for preventing and treating attaching and effacing Escherichia coli (AEEC) associated diseases”. PCT/CA02/00353 (demande internationale en cours).