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Accueil > Français > Équipes > Génomique de l’environnement et bioinformatique (MEB) > Recherches

Recherches

Contexte scientifique

L’objectif de l’écologie des communautés est de comprendre la structuration des assemblages, leurs changements dans le temps et dans l’espace et leurs interactions fonctionnelles. La communauté (...)

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Le lac comme écosystème modèle

Notre écosystème modèle pour étudier les communautés microbiennes est l’écosystème lacustre, pour lequel la diversité et la physiologie des microorganismes sont relativement peu étudiées comparativement (...)

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Hypothèses, objectifs

Hypothèse 1 Les clades microbiens mis en évidence sont écologiquement distincts et correspondent donc à des écotypes (Ward et al., 2008).
Hypothèse 2 – Mécanismes de spéciation : Les Virus seraient (...)

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Quelques travaux....

Sur la spéciation
Paléolimnologie : Évolution des écotypes au sein des Cyanobactéries et des Diatomées (exemple : Programme ANR IPER-RETRO) (Savichtcheva et al. 2011)
Microenvironnements (...)

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Méthodologies

Développement de méthodes permettant d’étudier la structure et le potentiel génétique des communautés microbiennes
1 - Métagenomique
2 - Bioinformatique : Développement d’ouils de traitement de données (...)

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